O edifício do Colégio Infante Santo é constituído por um único bloco, que compreende dois pisos, com uma área de 1134 m2 cada.
O Colégio Infante Santo dispõe de salas de aula comuns, laboratórios de Ciências, Informática, Expressão Artística e Tecnológica e uma sala dedicada às artes plásticas.
No piso zero existem os seguintes espaços: secretaria, sala de professores, sala de trabalho de professores, gabinete de directores de turma, gabinete de psicologia e orientação, papelaria / reprografia, refeitório, bar / sala de convívio, balneários, W.C. alunos, W.C. professores, W.C. pessoal auxiliar, biblioteca, laboratórios de Ciências naturais e de Ciências físico-químicas, auditório/ pavilhão multiusos, sala de Educação Visual e Tecnológica e sala Educação Visual.
O espaço exterior é amplo e aprazível. Tem a dimensão de 48000 m2 e é ocupado com jardim, espaços de recreio e desportivos, um campo de futebol, um polidesportivo para a prática de diferentes modalidades: andebol, voleibol, basquetebol e ténis.